Salezijanci danas djeluju u Hrvatskoj u župama i odgojno-obrazovnim ustanovama – školama, oratorijima i omladinskim centrima.

U Zagrebu su četiri odgojno-pastoralna središta: na Knežiji – Župa Marije Pomoćnice, oratorij, internat i provincijalat; u Podsusedu – Župa Sv. Ivana Bosca i zajednica za odgoj salezijanskih zvanja; u Jarunu – Župa Duha Svetoga, oratorij i svetište Sveta Mati Slobode; u Rudešu – Župa Sv. Ane i oratorij .

U Rijeci su odgojno-pastoralne prisutnosti: Salezijanska klasična gimnazija, Župa Marije Pomoćnice i oratorij , Župa Sv. Josipa i Župa Sv. Antuna Padovanskog.

U Splitu Župa Marije Pomoćnice, oratorij i omladinski centar "Ivan Pavao II". U Zadru Župa Gospe Loretske (oratorij ),u Dubrovniku (Nova Mokošica) Župa Sv. Obitelji (oratorij ), u Belom Manastiru Župa Sv. Martina i omladinski centar.

Salezijanci djeluju i u drugim manjim mjestima, kao što su: Badljevina (Župa Sv. Ivana Krstitelja), Sirač (Župa Pohođenja BDM) i drugdje. U Bosni i Hercegovini, u Žepču, salezijanci su podigli Katolički školski centar "Don Bosco" u sklopu kojega su gimnazija, tehnička škola i omladinski centar.